在我國，排在重大傳染病前三位的是艾滋病、病毒性肝炎和肺結核。這些疾病的防控關乎人民群眾的健康與生命。國家因此設立了“傳染病防治”重大科技專項。

　　近年來，該專項聚焦傳染病防控關鍵領域，通過核心技術突破和關鍵技術集成，使我國傳染病科學防控自主創新能力達到國際先進水平，使我國保持艾滋病低流行水平，乙肝向中低流行水平轉變，肺結核新發感染率和病死率降至中等發達國家水平。

　　甲型流感防控：展示了我國對全球傳染病防控的突出貢獻

　　2009年年初，H1N1甲型流感這種新型流感在全球暴發。我國迅速創建了由原衛生部牽頭、科技部等38個部委參與的聯防聯控機制，針對流感防控中的關鍵性科技問題，開展多學科集成大協作攻關研究，以傳染病科技重大專項總體組為核心的聯防聯控機制專家委員會，科學有序應對疫情。

　　在科研人員的努力下，我國在世界上首先研制成功新甲流診斷試劑，并及時在全國和12個發展中國家推廣應用;在國際上首先精確揭示新甲流感染臨床特征和病毒核酸衍變規律，提出新甲流的治療方案和重癥甲流的抗病毒、抗ARDS、抗休克、抗感染、維持水電解質和微生態平衡的救治策略，顯著降低了病死率，成為世界衛生組織制定全球新甲流診療方案的重要依據。

　　甲型流感疫情防控成效，成為我國重大傳染病防控和科技攻關集成創新一個成功的范例，多個國際公共衛生和新聞機構、專業期刊高度評價中國甲型流感防控中的做法、成果和作用，展示了我國對全球傳染病防控的突出貢獻。

　　H7N9禽流感防控：世界衛生組織認可的應急響應典范

　　H7N9禽流感是一種新型禽流感病毒，具有較高的病死率。2013年3月，H7N9在我國華東地區出現。針對該新發傳染病，在傳染病重大專項中承擔任務的研究團隊，積極開展了H7N9禽流感的病原識別與確認、診斷、治療、技術與基礎研究，以及疫情防控。

　　我國疾控與臨床專業科研人員自主和通過診防治聯合技術平臺合作攻關，獲得標本后，5天內查明該新病毒，還研發了具有自主知識產權的H7N9禽流感病毒核酸診斷試劑盒，為診治發揮了積極作用，并向周邊國家提供了技術培訓和診斷試劑;成功研制出H7N9病毒疫苗種子株，打破了流感疫苗株依賴進口的歷史。

　　世界衛生組織在其《人感染H7N9禽流感防控聯合考察報告》中評述：中國對H7N9禽流感疫情的風險評估和循證應對可作為今后類似事件應急響應的典范。

　　創建了集成創新性的傳染病防控綜合技術平臺

　　“H1N1甲型流感和H7N9人感染高致病性禽流感的暴發疫情應對，是近年來我國傳染病綜合防控能力提升的縮影，充分展現了我國傳染病綜合防控能力的提升?！敝袊膊☆A防控制中心主任、中國科學院院士高福表示，在“傳染病防治”重大科技專項的支持下，我國傳染病防控體系創建了集成創新性的傳染病防控綜合技術平臺，從診、防、治方面加強技術創新和防控機制創新，初步形成了國際先進水平的突發急性傳染病防控技術體系。

　　科技部提供的數據顯示：截至2018年12月31日，專項針對重大傳染病研發多種預防、診斷產品，優化防治方案：艾滋病毒核酸試劑將檢測窗口期從28天縮短到7天以內，全球首支60μg乙肝疫苗大大降低接種的低應答率和無應答率，艾滋病病死率從2010年的10.7%下降到4.6%，急性重型肝炎病死率由88.1%降至21.1%，以及全球首個2014基因突變型埃博拉疫苗，實現72小時內鑒定300種已知病原及罕見病原。